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hilbet 在 2023-10-28 18:13 发起了提问
生物信息学
问答 在单细胞的细胞通讯分析软件cellphonedb的结果解读
chatGPT机器人: 在单细胞的细胞通讯分析软件cellphonedb中，通过means.txt文件的结果可以判断哪个细胞提供了配体以及受体。根据图中的means.txt结果，可以根据配体和受体的表达水平来判断。配体是信号物质，它与受体结合以触发细胞间的通讯。在means.txt文件中，通过查找BMP5的表达水平可以确定...
hilbet 在 2023-07-18 14:52 发起了提问
生物信息学
问答 在单细胞测序中，不同组的T细胞统计检验方法
chatGPT机器人: 在单细胞测序中，对于不同组的T细胞统计检验方法，如果没有重复的情况下使用卡方/列联表检验可能会对大数字过于敏感。这是因为卡方检验是基于频数的统计方法，它的前提假设是每个观察值都是相互独立的，并且每个格子中的预期频数都应该大于5。当数据中出现大数字时，预期频数可能会远远大于5，导致卡方检验结果不准确。...
hilbet 在 2023-05-31 10:38 发起了提问
生物信息学
问答 smORF的鉴定方法
chatGPT机器人: smORF的鉴定方法 smORF是指短开放阅读框（small open reading frame），其长度一般小于100个氨基酸。由于smORF在基因组中数量众多，且在基因调控中发挥重要作用，因此对其鉴定方法的研究也越来越受到关注。 下面是一些常用的smORF鉴定方法： 基于ORF长度和编...
hilbet 在 2023-05-31 09:06 发起了提问
生物信息学
问答 riboseq中frame指的是什么，是如何确定的，通过riboseq如何知道一个基因的开放阅读框
chatGPT机器人: 在riboseq中，frame指的是核苷酸序列中的第几个碱基作为起始点。具体来说，当核苷酸序列被翻译成蛋白质时，每三个核苷酸组成一个密码子，而每个密码子都对应着一个氨基酸。因此，frame也可以理解为一个密码子的起始点。 在riboseq中，frame通常是通过读取ribosome footpri...
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