城管大队哈队长 初级会员

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城管大队哈队长 在 2018-10-13 11:53 回答了问题
基因组组装资料分享
基因组组装
城管大队哈队长: 基因组组装的话，推荐看生信媛公众号，里面徐洲更一直在做基因组组装的工作。
城管大队哈队长 在 2018-10-10 17:49 回答了问题
htseq
htseqcount和featurecount计数不一样
城管大队哈队长: [attach]309[/attach]  
城管大队哈队长 在 2018-10-09 20:27 发起了提问
htseq
问答 htseqcount和featurecount计数不一样
孟浩巍: htseq-count 里面有简单的过滤设置，你看你图中是分红色和蓝色的， 其中红色代表的是map到正链的，蓝色代表的是map到负链的reads。 而你的gene是一个负链gene，我猜你可能是htseq-count统计的时候分链了。
城管大队哈队长 在 2018-09-19 21:09 回答了问题
从基因组上获取序列
知道一批基因的具体位置，如何批量的从基因组中取出基因序列？
城管大队哈队长: 制作成bed文件，用bedtools的getfasta即可。 楼主你的文件应该就是bed格式了。改个bed后缀直接用就行。  
城管大队哈队长 在 2018-09-13 16:33 回答了问题
samtools
两个samtools命令之间用管道连接，最后的输出文件被吞了。
城管大队哈队长: 找到原因了。。。。。。。{id}应该改成{i}
城管大队哈队长 在 2018-09-13 16:09 发起了提问
samtools
问答 两个samtools命令之间用管道连接，最后的输出文件被吞了。
城管大队哈队长: 找到原因了。。。。。。。{id}应该改成{i}
城管大队哈队长 在 2018-09-08 16:49 发起了提问
deeptools. ChIP_seq
问答 含有2个重复的Chip-seq的bw文件的展示
孟浩巍: 怎么展示的都有，怎么漂亮怎么来。
城管大队哈队长 在 2018-08-30 16:29 发起了提问
Chip_Seq
问答 老铁们，我想问下，如果homer找到了motif1，那我有可能反过来知道哪些peak含有motif1么。
孟浩巍: 我提供一个思路哈，不一定是最简单的办法： 1. 将bed里面的region注释上genome序列，可以使用R里面的BSgenome进行； 2. 在bed里面进行搜索motif序列，可以使用R里面的Biostring进行；  
城管大队哈队长 在 2018-08-24 22:57 回答了问题
电脑配置
请教一个电脑配置的问题
城管大队哈队长: 屏幕加主机 1w2上下即可。 感觉这个问题应该挺有广泛性的。感觉服务器上跑程序的还是居多的(´▽`ʃƪ)，希望懂的老铁能帮忙回答下。
城管大队哈队长 在 2018-08-24 22:54 发起了提问
电脑配置
问答 请教一个电脑配置的问题
城管大队哈队长: 屏幕加主机 1w2上下即可。 感觉这个问题应该挺有广泛性的。感觉服务器上跑程序的还是居多的(´▽`ʃƪ)，希望懂的老铁能帮忙回答下。
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