mamba安装记录

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17819570930 渣渣辉

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conda好用,但有时候装包太慢太慢了。   

好在我们可以用mamba(python命令行版的conda)替代,实测安装软件的速度有大幅提升。  

micromamba(C++版conda)的安装教程请参考这个 

理论上来说,micromamba应该会更快一点。但我觉得mamba已经可以了,所以没有试过micromamba。  

感兴趣的请自己尝试下。  

Tip:
在安装mamba之前,需要先卸载conda。可以把conda环境导出为yaml文件,然后再在mamba里导入yaml文件建立环境。

 

从当前环境导出yaml文件

conda env export xxx.yaml

根据导入的yaml文件建立新环境

conda env create -f xxx.yaml

下载mamba

wget https://github.com/conda-forge/miniforge/releases/latest/download/Mambaforge-pypy3-Linux-x86_64.sh

 

安装mamba

bash Mambaforge-pypy3-Linux-x86_64.sh

 

安装完后先配置镜像源

由于肉身在广东,所以我配置的是南科大的镜像源。  

进入南科大镜像网站conda页面,直接复制~/.condarc里的内容到自己的~/.condarc文件里。  

当然,你也可以选择运行下列命令(二选一哈):

conda config --add channels https://mirrors.sustech.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
conda config --add channels https://mirrors.sustech.edu.cn/anaconda/pkgs/main/
conda config --set show_channel_urls yes

 

其他conda镜像源:

清华conda镜像
conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/ conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/main/ conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/pytorch/ conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/pytorch/linux-64/ conda config --set show_channel_urls yes

北外conda镜像

conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/free/ conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/pkgs/main/ #Conda Forge conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/ #msys2(可略) conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/msys2/ #bioconda(可略) conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/ #menpo(可略) conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/menpo/ #pytorch conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/pytorch/ # for legacy win-64(可略) conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/peterjc123/ conda config --set show_channel_urls yes

 

更多conda操作请参考这个帖子

发布于 2023-05-17 10:08

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本文由 17819570930 原创发布于 生信坑 ,著作权归作者所有。

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