Hisat建立索引
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起始于南农 这家伙很懒，还没有设置简介
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HISAT2建立索引有必要加上提取剪切位点和外显子信息这两个参数吗？比如
extract_splice_sites.py Mus_musculus.GRCm39.104.gtf > Mus_musculus.ss
extract_exons.py Mus_musculus.GRCm39.104.gtf > Mus_musculus.exon
hisat2-build --ss Mus_musculus.ss \
--exon Mus_musculus.exon \
Mus_musculus.GRCm39.dna.primary_assembly.fa \
Mus_musculus.GRCm39_tran
还有就是extract_splice_sites.py 、 extract_exons.py这两段脚本怎么获取，是hisat2安装后自带的吗？
2023-05-31 15:44