Ideogram的画法

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Ideogram可视化

今天看到了一篇关于自闭症的文章，文中放了一张标识所有自闭症相关基因的Ideogram plot，有没有人知道有什么工具能够方便地画出这样的图？我知道bioconductor上有一些画Ideogram的包，并且可以和chip-seq数据一块可视化，但是像附件这样的图我还是觉得比较棘手。主要是基因分布不均一，基因名的坐标不好确定。

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孟浩巍超级管理员用户来自于: 北京市
2018-09-08 10:15

这种ideogram，目前我认为比较好用的工具是 Bioconductor里面的IdeoViz包； [attach]164[/attach] 但是如果想要你说的这个效果，我觉得绝大多数情况下，应该都是画完以后后期再美化的。

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Jarning 初级会员用户来自于: 日本
2018-09-08 10:08

目前我在Biostars找到了一些解决方案，但是显然离上图还有很大从差距。 https://www.biostars.org/p/378/

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发布时间: 2018-09-08 09:58

更新时间: 2018-09-08 10:15

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