【求助】如何确定一种基因ID的类型 - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

4: 关注

3651: 浏览

【求助】如何确定一种基因ID的类型

例如：有三种不同类型的基因ID用于描述玉米的某些基因，如何用R知道，这是属于什么类型的（symbol、ensemble...） 1. Zm00001d035139 Zm00001d025707 Zm00001d046812 Zm00001d031303 2. NR_028022.2 NR_036655.1 NM_001149456.1 XM_008650099.1 3. GRMZM2G010044 GRMZM2G175593 GRMZM2G468111 GRMZM2G152179 GRMZM2G006352 GRMZM2G133988

好问题 0 评论收藏举报

查看全部 2 个回答

灵动的小猪初级会员用户来自于: 河南省
2018-08-24 00:32

对于NR,NM,XM一类的，根据前面的编号看是什么类型的ID。而你的这个玉米的基因，Zm0000开头的是第四版的ID，GRMZM开头的是第三版的ID，可以在maizegdb网站首页下载他们的对应关系，同时也可以使用ensembl的biomart来进行版本的转换。

赞同 3 0评论

关于作者

: 徐寅生 初级会员
这家伙很懒，还没有设置简介

1: 回答

0: 文章

10: 问题

问题动态

发布时间: 2018-08-23 22:40

更新时间: 2018-08-24 00:32

关注人数: 4 人关注

相关问题

如何一个数据表中第一列都统一删除三个字母保留数字再输出为一个新表: 2638 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

如何根据转录组数据得到新转录本？如何验证一个基因的多个转录本？: 3762 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

统计学，如何从入门到放弃？: 2157 浏览 3 关注 1 回答 0 评论

如何知道自己测序的adapter序列？: 2751 浏览 3 关注 1 回答 0 评论

求助，运行软件时遇到perl问题: 2649 浏览 1 关注 1 回答 0 评论

用scanpy做单细胞分析，如何去除周期细胞的影响: 3481 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

WGCNA筛选到感兴趣的模块后，如何找这个模块的hub基因呢？: 2819 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

如何在20个蛋白序列里找3个motif: 1226 浏览 2 关注 0 回答 0 评论

如何从NCBI上分别下载所有的RNA病毒和DNA病毒的序列: 3653 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

如何处理fastqc报告中duplication level报错的问题: 3911 浏览 3 关注 2 回答 0 评论

推荐内容

问 GEOquery下载GEO数据软件报错: 4357 浏览 4 关注 3 回答 0 评论

问安装anaconda时conda命令无法起作用: 3783 浏览 5 关注 5 回答 0 评论

问 fastsimcoal群体历史动态模拟bootstrap时的maxL.par文件设置: 3067 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 tsRNA测序思路求助: 2900 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问关于gene id转换以及“org.Hs.eg.db"包（小剧场？）: 3818 浏览 4 关注 3 回答 0 评论

问基因互作网络和蛋白互作网络: 2400 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问 ID mapping: 2148 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问新人求教关于测序以及免疫的问题: 1980 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 ggtree可视化NJ树: 2288 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2026