Chip-seq bam文件的处理

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含有2个重复的Chip-seq的bw文件的展示

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ChIP-seq的bigwig文件可以使用rpkm>1过滤掉一些弱的信号吗？

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Hi-C热图人工纠错

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chip-seq数据下载有多个SRA

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log2(fold_change)可以用来做热图吗？遇到想要表达的目的基因log2(fold_change)值为0时，怎么办？

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chipseq分析，利用deeptools的computeMatrix reference-point画样本的peak center信号图

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用R画RNA_seq中变化显著的heatmap聚类热图

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deeptools对ChIP-seq可视化中bw文件的选择问题？

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耐药细菌的比较基因组分析流程和机制探索

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问 bowtie2比对 报错

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问 SRA 数据批量下载

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问 是不是单细胞的chip-seq，cut run这些call peak是不需要对照的，我看代码里没有-c.所以Rna-seq的峰图也是不需要control来call peak的吗？

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问 chip-seq 绘制bed 文件区域的 h3k27ac等修饰的 信号强度图

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问 CUT&TAG 的GC含量异常

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问 annotatePeak peak基因组注释

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问 验证数据集基因名称

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问 MEME motif analysis 软件的安装

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问 ROSE算法寻找SEs

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问 ChIP-seq测序深度

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