首页
问答
文章
专栏
大咖
更多
话题
帮助
请输入关键字进行搜索
查看更多 "
" 的搜索结果
登录
如何知道自己测序的adapter序列?
关注问题
回答问题
该问题已被锁定!
3
关注
2752
浏览
如何知道自己测序的adapter序列?
序列处理
测序的adapter序列是需要测序公司提供还是自己用什么软件也可以查看到?
阅读全文
收起全文
关注问题
回答问题
邀请回答
好问题
0
评论
收藏
举报
分享
复制链接
新浪微博
腾讯空间
微信扫一扫
展开
收起
0
评论
查看全部
1
个回答
Jarning
初级会员
用户来自于: 安徽省合肥市
2018-08-26 08:36
可以利用fastqc先对你手里的数据进行质控,在fastqc report中的最后一栏
里,fastqc会将你数据中的adapter列出。参考fastqc的官方文档: [url]https://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/Help/3%20Analysis%20Modules/10%20Adapter%20Content.html[/url] 当然,这个时候,你只知道adapter的name,如果要对应序列,可以参考: [url]https://github.com/csf-ngs/fastqc/blob/master/Contaminants/contaminant_list.txt[/url] 目前测序数据中最有可能出现的adapter基本上就是illumina universal adapter了,其序列如下 >Multiplexing_Read_1_Sequencing_Primer_3_to_5 AGATCGGAAGAGCGTCGTGTAGGGAAAGAGTGT >Multiplexing_Read_2_Sequencing_Primer_3_to_5 AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCAC 公司能直接提供adapter序列是最好的。
阅读全文
收起全文
赞同
3
0
评论
分享
复制链接
新浪微博
腾讯空间
微信扫一扫
0
评论
关于作者
GDCDC
初级会员
这家伙很懒,还没有设置简介
2
回答
0
文章
3
问题
问题动态
发布时间
2018-08-25 18:05
更新时间
2018-08-26 08:37
关注人数
3 人关注
相关问题
perl的如何进行读取和循环的
2482 浏览
3 关注
2 回答
0 评论
如何对特征数量少的空间蛋白组数据进行细胞聚类?
2744 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
群体进化,重测序,选择分析
2201 浏览
1 关注
1 回答
0 评论
请问下这种格式的R语言内容如何选择最小值
2405 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
stringtie 得到的gtf 通过DESeq2分析后stringtieID 如何转换成esmbleID
2424 浏览
3 关注
2 回答
0 评论
sudo apt-get install gcc++出现如下报错该如何解决?系统是:ubuntu14 server 版
1866 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
请问如何使用R语言绘制散点图
2688 浏览
1 关注
2 回答
0 评论
x <- x[keep.exprs,, keep.lib.sizes=FALSE] 请问一下这条命令该如何解读呢?
1391 浏览
1 关注
0 回答
2 评论
Ubuntu 14.04 server,如何进行网络配置呢?
2199 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
【求助】如何确定时期特定表达基因
2003 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
All Rights Reserved Powered BY
WeCenter V4.1.0
© 2026
关于我们
社区规范
你的浏览器版本过低,可能导致网站部分内容不能正常使用!
为了能正常使用网站功能,请使用以下浏览器
Chrome
Firefox
Safari
IE 10+