rna-seq数据校正 - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

2: 关注

2957: 浏览

rna-seq数据校正

生信问题

请问，rna-seq数据处理完之后发现gapdh的值差异较大，可以通过gapdh来校正其它基因的表达量吗？

好问题 0 评论收藏举报

2 回答

孟浩巍超级管理员用户来自于: 北京市
2018-09-27 14:39

一般来说，不这么办，表达量特别高的gene本身的表达量用RNA-Seq衡量就不是很准；如果真的要确定是否有变化，你需要选择多个内参然后进行qPCR。以实验的结果为准。还有一个办法是掺入spike-in，最常用的是ERCC序列。

赞同 2 0评论

i_thinking 注册会员用户来自于: 北京市
2018-09-27 15:04

好的，感谢孟老师

赞同 0 0评论

关于作者

: i_thinking 注册会员
这家伙很懒，还没有设置简介

5: 回答

0: 文章

4: 问题

问题动态

发布时间: 2018-09-26 09:49

更新时间: 2018-09-27 15:04

关注人数: 2 人关注

相关问题

求重测序不同群体示例数据: 1460 浏览 1 关注 0 回答 1 评论

单细胞数据的多个lib是什么意思呢？: 2374 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

如何根据转录组数据得到新转录本？如何验证一个基因的多个转录本？: 4375 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

sc-ATAC数据质控: 3130 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

Hichip得到loop数据如何注释？: 3026 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

尿代谢组正负离子数据标准化是否可以均用正离子检测出来的肌酐峰: 2346 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

无对照的转录组数据如何寻找差异表达基因: 3497 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

如何使用seqtk按照比例随机提取单细胞数据？: 3657 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

二代测序得到测序数据组装完成后如何进行丰度计算: 3045 浏览 1 关注 1 回答 0 评论

Bulk-RNAseq多组数据差异表达基因的筛选: 3660 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

推荐内容

问关于基因间的相关性分析: 3232 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问使用Tracking Tumor ImmunoPhenotype(TIP)网站分析TCGA的BLCA_tpm数据: 3004 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问尿代谢组正负离子数据标准化是否可以均用正离子检测出来的肌酐峰: 2346 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问使用tophat2和bowtie1寻找环形RNA时报错: 3544 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问关于生存分析的问题: 1485 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

问 linux下使用convert出现报错，可能是什么原因？如何解决？: 3256 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 juicer_tools.jar hiccups 运行怎么更改物种？: 3819 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问 infercnv运行报错: 7341 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问请问下这种格式的R语言内容如何选择最小值: 2728 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问请问cytoscape是怎么构建网络的？: 2260 浏览 3 关注 1 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2026