qliu 初级会员

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qliu 在 2018-09-08 20:49 发起了提问
差异基因软件比较
问答 关于tophat2 + cufflinks 得到的差异基因和featureCounts差异基因数目相差太大原因
qliu: 图中mut开头的表示我用sujunc+featureCounts+DESeq2得到的差异基因，zsl表示我用cuffdiff得到的差异基因， 请问为啥和cufflinks的结果差别这么大呢，谢谢了 [attach]167[/attach] 我之前比较过不用的比对软件得到bam然后再用reads得到差...
qliu 在 2018-08-31 11:31 发起了提问
deeptools. ChIP_seq
问答 deeptools对ChIP-seq可视化中bw文件的选择问题？
孟浩巍: bw是bigwig文件，里面包含了genome上每个稳点的覆盖情况，一般是从BAM文件转换到bw文件。 如果是做全genome的可视化以及质控，比如衡量是否富集，衡量相关性等等，我建议用全genome的bw去做。  
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