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海王坑在 2018-10-07 15:50 回答了问题 旅游攻略: 如何在西宁附近旅游三天; 海王坑: 茶卡盐湖西宁市里有个马尔沙清真牛杂可以去吃下; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

海王坑在 2018-10-01 12:36 回答了问题 R语言: 如何一个数据表中第一列都统一删除三个字母保留数字再输出为一个新表; 海王坑: R语言：用gsub()函数; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

海王坑在 2018-09-30 22:41 回答了问题 差异基因 RNA_seq: RNA-seq不同样本多个生物学重复不同处理条件下的如何找差异基因; 海王坑: 思考了一下，具体还是看自己的目的，我核心目的是比较OE后相对WT 的变化，因此需要将处理和未处理的分开；也就是18组数据分成处理和未处理分开来进行分析，也就是变成了9组数据，比如未处理的：WT-N,OE-1-N,OE-2-N，先将OE-1-N与WT比较，得到差异基因，再用OE-2-N与WT比较，得到...; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

海王坑在 2018-09-29 22:50 回答了问题 mapping RNASeq数据处理 Live问题: 20170804高通量测序视频中05 mapping.sh报错问题; 海王坑: 骨架代码没问题，for后面还是加个case name 之类的吧，只能多试下，重新建index; 赞同0 反对 0 人感谢 1 评论 2 回复

海王坑在 2018-09-25 09:55 回答了问题 wget winscp ENCODE: 用wget 在服务器上用wget下载ENcode里的chip-seq测序原始数据，提示可以connected,但一直no data received ?; 海王坑: nohup wget -c url &(断点续传，多大都能下）; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

海王坑在 2018-09-20 14:02 回答了问题 CHIpseeker: ChIPseeker 报错; 海王坑: covplot(F, weightCol="V5") 这一步能出图吗？不能的话，前面文件载入和包的问题 R语言里面方括号表示数组下标，看不懂你这F_peak; 赞同1 反对 0 人感谢 1 评论 1 回复

海王坑在 2018-09-17 19:53 回答了问题 hmmer lncRNA: 请问hemmer是否可以使用转录组搜索HMM库？; 海王坑: ###############################谢邀 #hmmer是要用蛋白序列分析的，分析的目的是筛选lncRNA的话，用pfam的数据库; 赞同1 反对 0 人感谢 2 评论 1 回复

海王坑在 2018-09-15 22:17 回答了问题 CHIpseeker: CHIPseeker; 海王坑: 好吧问题已解决，重新安装包加载，还给包的作者发了邮件后，竟然收到了回复，很强。; 赞同1 反对 0 人感谢 4 评论 1 回复

海王坑在 2018-09-13 10:49 回答了问题 GEO: 在GEO profile 下载sra文件，RunInfo Table 和accession list 有什么区别，下载哪个文件; 海王坑: [attach]207[/attach]; 赞同0 反对 0 人感谢 2 评论 1 回复

海王坑在 2018-09-10 10:58 回答了问题 问题求解: linux系统中使用fastqc报错; 海王坑: [url]https://zhuanlan.zhihu.com/p/35711429参考这个[/url]; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 3 回复

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