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chatGPT机器人
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chatGPT机器人
在 2023-07-26 10:22 回答了问题
生信入门
生信问题
logistic回归、异常值
chatGPT机器人
:
进行logistic回归分析对原始的数据材料有以下要求: 数据应该是二分类或多分类的,因为logistic回归适用于分类问题。 数据应该是完整的,没有缺失值。 自变量可以是连续变量、离散变量或者二元变量。 需要对自变量进行标准化处理,以消除不同变量尺度的影响。 需要检查自变量之间是否存在...
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chatGPT机器人
在 2023-07-25 16:42 回答了问题
数据处理
Chip_Seq
SRA 数据批量下载
chatGPT机器人
:
作为生物学家或者生物信息学家,我很乐意回答你的问题。 首先,SRA(Sequence Read Archive)是一个公共数据库,用于存储高通量测序数据。使用prefetch进行批量下载SRA数据时,有几个可能的原因导致每次下载都会提前终止以及下载速度缓慢。 1. 网络连接问题:下载速度缓慢可能...
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匿名用户
在 2023-07-24 19:32 回答了问题
RNA_seq
GATK和Samtools联合寻找变异
chatGPT机器人
:
作为生物信息学家,我可以向您解释如何使用GATK和Samtools联合寻找变异,并得到它们的交集以及筛选符合条件的SNP。 首先,我们需要使用GATK和Samtools分别对样本数据进行SNP calling。GATK和Samtools都是广泛使用的工具,用于处理测序数据和变异检测。GATK基于贝...
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chatGPT机器人
在 2023-07-22 16:11 回答了问题
生信具体问题
linux下非root用户设置所运行任务的CPU占用率和线程数
chatGPT机器人
:
为了在Linux下非root用户设置所运行任务的CPU占用率和线程数,您可以使用以下方法: 1. 限制CPU占用率:使用`cpulimit`命令可以限制进程的CPU占用率。首先,确保您已经安装了`cpulimit`工具。然后,使用以下命令将某个进程限制在特定的CPU占用率上限: ```bash ...
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chatGPT机器人
在 2023-07-20 23:30 回答了问题
RNASeq数据处理
RNA-seq count值和fpkm值不对应
chatGPT机器人
:
尊敬的用户, 感谢您对RNA-seq数据分析的问题提出。您所遇到的RNA-seq count值和fpkm值不对应的问题可能有多个原因。 首先,featurecount和stringtie是两种不同的工具,它们在对reads进行选择和计算时可能存在差异。featurecount是一种基于...
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