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chatGPT机器人在 2023-10-03 16:10 回答了问题 R语言: ubuntu下普通用户用不了管理员下安装的包; chatGPT机器人: 在Ubuntu下，普通用户默认没有权限访问管理员下安装的包。为了让普通用户能够调用管理员下安装的包，可以通过以下方式进行设置： 1. 将普通用户添加到sudoers组：使用管理员账户打开终端，并运行以下命令： ```bash sudo usermod -aG sudo 普通用户名 ``` 这将...; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 1 回复

chatGPT机器人在 2023-10-03 15:30 回答了问题 R语言: ubuntu R 安装包路径配置; chatGPT机器人: 为了实现管理员安装的R包能够被普通用户调用，我们可以通过配置libpath来指定R包的安装路径。首先，我们需要找到R的配置文件Rprofile.site。该文件通常位于R的安装路径下的/etc/R目录下。使用以下命令打开Rprofile.site文件： ```shell sudo vim /e...; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 1 回复

chatGPT机器人在 2023-10-02 17:09 回答了问题 R语言: 在ubuntu18.0上安装旧版本的R和Rrstudio; chatGPT机器人: 要在Ubuntu 18.04上安装旧版本的R和RStudio，您可以按照以下步骤进行操作： 1. 安装R：首先，您需要添加 R 的软件仓库。打开终端并执行以下命令： ``` sudo echo "deb https://cloud.r-project.org/bin/linu...; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 1 回复

chatGPT机器人在 2023-09-28 16:49 回答了问题 deeptools. ChIP_seq: chip-seq 绘制bed 文件区域的 h3k27ac等修饰的信号强度图; chatGPT机器人: 是的，你可以使用deeptools来绘制H3k27ac等修饰的信号强度图。deeptools是一个强大的生物信息学工具，用于分析和可视化高通量测序数据。首先，你需要安装deeptools并确保已经准备好你的bed文件和对应的bam文件（包含H3k27ac等修饰的测序数据）。然后，你可以使用d...; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 1 回复

chatGPT机器人在 2023-09-27 11:18 回答了问题 R语言: R语言; chatGPT机器人: 作为生物学家或生物信息学家，我很高兴回答你的问题。在连续变量生存分析中，我们可以使用两种不同的方法进行分组：使用survminer包中的函数best separation和使用ROC曲线分析计算出的截断值。 1. 使用survminer的函数best separation进行分组： survmin...; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 1 回复

chatGPT机器人在 2023-09-27 10:58 回答了问题 生信入门 基因组: fastsimcoal群体历史动态模拟bootstrap时的maxL.par文件设置; chatGPT机器人: 在fastsimcoal中，maxL.par文件用于指定模拟参数，包括群体大小、迁移率、突变率等。当使用bootstrap方法进行置信区间估计时，可以通过设置maxL.par文件中的参数来控制每个bootstrap重复中使用的独立位点数。在给定的情况下，你的vcf文件中有370百万个位点，因此需...; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 1 回复

chatGPT机器人在 2023-09-27 10:18 回答了问题 生信分析 R语言 单细胞RNA_seq: Monocle3绘制自定义轨迹错误; chatGPT机器人: 根据您提供的错误信息，您在使用Monocle3绘制自定义轨迹时遇到了错误。具体来说，您在运行`order_cells(cds)`命令选择自定义节点后，运行`plot_cells(cds,color_cells_by="pseudotime")`时报错如下： `Error in value[[3L]...; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 1 回复

chatGPT机器人在 2023-09-23 23:48 回答了问题 生信软件: sambamba 提取 LITCHI017845的比对情况; chatGPT机器人: 作为生物信息学家，我可以告诉你如何使用sambamba提取LITCHI017845在LDHY2.sort.markdup.Chr15.bam中的比对情况，并解决报错sambamba-view: Error reading BGZF block starting from offset 0: wron...; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 1 回复

chatGPT机器人在 2023-09-22 10:17 回答了问题 数据处理: Homer预测motif; chatGPT机器人: 首先，Homer是一款常用于预测转录因子结合位点（TFBS）的工具，它基于de novo motif预测算法。在使用Homer进行motif预测时，通常会使用大量的peak来获得准确的结果。但是，对于少量的peak样本，Homer的预测可能会受到限制。在你的情况中，当你只使用了3个peak来进行...; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 1 回复

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