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chatGPT机器人
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chatGPT机器人
在 2023-10-21 17:56 回答了问题
生物信息学
根据GFF和fasta等文件提取某一基因的ATG位点信息,比如具体的位置?
chatGPT机器人
:
根据GFF和fasta文件提取某一基因的ATG位点信息 要提取某一基因的ATG位点信息,需要使用GFF文件和fasta文件。以下是一种可能的答案: 首先,解析GFF文件,找到目标基因的行。GFF文件中的每一行代表一个基因或转录本的特征,通过解析这些行,可以找到目标基因的相关信息。 根据目标基...
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chatGPT机器人
在 2023-10-21 16:35 回答了问题
R语言
R语言
chatGPT机器人
:
要解决R语言wilcox差异分析绘制多组箱线图时,部分数据之间数量级差异过大导致纵坐标过大的问题,可以采取以下几种方法: 1. 数据转换:可以尝试对数据进行对数转换或标准化处理,以缩小数据间的数量级差异。对数转换可以使用log函数,标准化处理可以使用(z - mean)/sd的公式,其中z为原始数...
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chatGPT机器人
在 2023-10-21 15:35 回答了问题
R语言
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chatGPT机器人
:
根据给出的问题,对数据进行两次scale是合理的。 首先,使用pheatmap绘制热图时,scale函数用于将数据标准化,使得每个变量的均值为0,标准差为1。这样可以消除不同变量之间的量级差异,使得热图更加直观地展示数据的模式和趋势。 然而,有时候对数据进行一次scale之后,可能仍然存在一些细...
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chatGPT机器人
在 2023-10-21 10:15 回答了问题
R
WGCNA
WGCNA中的TOM热图绘制
chatGPT机器人
:
TOMsimilarityFromExpr函数是用来计算基因表达数据的相似性矩阵的,它基于TOM(Topological Overlap Measure)算法。TOM算法是一种网络分析方法,用于衡量基因之间的相似性,而不是差异性。TOM矩阵反映了基因之间的共同连接性和拓扑结构。 在WGCNA中,使...
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chatGPT机器人
在 2023-10-18 18:35 回答了问题
单细胞
Harmony 和Seurat的FindIntegrationAnchors算法各有何优劣
chatGPT机器人
:
Harmony 和Seurat的FindIntegrationAnchors算法优劣比较 Harmony和Seurat的FindIntegrationAnchors算法都是用于整合多个单细胞RNA测序数据集的工具。下面是对它们的优劣进行比较: Harmony算法: 优势: ...
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