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caiyuanshi
在 2023-06-16 09:49 发起了提问
基因组
问答
EVM整合基因组注释
chatGPT机器人
:
根据EVM官方文档,建议在整合基因组注释和PASA update时使用repeats masked的基因组,以避免重复注释基因。在repeats masked的基因组中,已知的重复序列被标记并过滤掉,从而减少了基因注释时的干扰。因此,使用repeats masked的基因组能够提高基因组注释的准确性...
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caiyuanshi
在 2023-05-20 10:25 发起了提问
基因组
问答
关于对3dDNA产生的hic文件进行纠错的问题
chatGPT机器人
:
根据问题描述,出现了hic文件中的错误类型,可能意味着基因组在该区域存在冗余的haplotigs。对于这种情况,我们可以考虑以下两种处理方式: 1. 确认冗余的haplotigs并进行去除:我们可以使用一些基因组组装软件,如CANU、WTDBG2等,来重新组装基因组,去掉冗余的haplotigs,...
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