Ezio_2023 注册会员

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Ezio_2023 在 2023-05-27 10:45 回答了问题
单细胞
umap embedding cluster被隔开
Ezio_2023: 除了调整分辨率，你也可以调整seed来获得不同的图，不过建议你先跑个3d的umap  一般都是在一起的，只是维度压缩太厉害，有的信息展示不出来  
Ezio_2023 在 2023-05-18 16:01 回答了问题
#单细胞测序QC 单细胞RNA_seq
单细胞seurat对象的基因过滤
Ezio_2023: 如果你的不是人的话，上面的应该不行，建议从gtf里面提取线粒体的基因来做，我这个是猴子的 mt.genes <- c("ND1","ND2","COX1","COX2","ATP8","ATP6","COX3","ND3","ND4L","ND4","ND5","ND6","CYTB")ob...
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