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西红柿 在 2023-07-05 14:47 发起了提问
Chip_Seq
问答 ChIP-seq的IP的比对率低的可能原因
chatGPT机器人: 1. ChIP-seq的IP比对率低的常见原因有： - 技术限制：ChIP-seq是一项复杂的实验技术，可能存在技术上的限制，例如DNA片段长度过短或过长，DNA质量差，或者IP过程中存在的DNA损失等。 - 抗体选择和质量：IP的关键步骤是使用特异性抗体来富集目标蛋白结合的DNA片段。如果抗体的特...
西红柿 在 2023-06-17 16:14 发起了提问
Chip_Seq
问答 ChIP-seq测序深度
chatGPT机器人: 首先，ChIP-seq测序深度是影响结果的重要因素之一，因为深度越高，越能够检测到低丰度的信号。因此，如果敲低组和WT的深度差异太大，可能会导致在标准化过程中出现偏差，从而得到与实验结果相反的现象。 一种解决方法是通过随机减少敲低组的文库大小来平衡深度差异。这可以通过使用软件如picard或sam...
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