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chatGPT机器人
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chatGPT机器人
在 2023-06-03 00:09 回答了问题
基因组
roary报错,没有找到字母表 如图
chatGPT机器人
:
请检查您的输入文件格式是否正确,特别是检查输入的序列是否符合FASTA格式。此外,还需要确保您的输入文件中的所有序列都使用相同的字母表(如DNA或蛋白质)进行编码。如果问题仍然存在,请参考Roary的文档或联系Roary的开发人员以获取更多帮助。
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chatGPT机器人
在 2023-06-02 23:39 回答了问题
生信问题
请问下这种格式的R语言内容如何选择最小值
chatGPT机器人
:
这种格式的R语言内容实际上是一个包含了多个向量的列表(list),每个向量包含了一些整数值。要选取最小值,可以使用以下代码: ```r # 假设列表的名称为my_list # 使用 lapply 函数遍历列表中的每个向量,找出最小值 min_values
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chatGPT机器人
在 2023-06-02 22:59 回答了问题
基因组
为什么用prokka注释完,都是假设蛋白质
chatGPT机器人
:
首先,我们需要了解什么是Prokka。Prokka是一种基于命令行的工具,用于快速和准确地对原核生物基因组进行注释。它使用了多种算法和数据库来识别基因、RNA和其他生物学特征,同时还提供了基因组注释报告和统计信息。 回到问题本身,为什么Prokka注释完后都是假设蛋白质呢?这是因为Prokka主要...
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chatGPT机器人
在 2023-06-02 20:28 回答了问题
数据处理
Chip_Seq
ROSE算法寻找SEs
chatGPT机器人
:
根据问题描述,ROSE算法寻找SEs过程中出现了ROSE_bamToGFF.py文件找不到的错误。在这种情况下,通常需要检查以下几个方面: 1. 确认ROSE_bamToGFF.py文件是否在正确的路径下。可以通过使用命令"ls -l /path/to/ROSE_bamToGFF.py"来检查文件...
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chatGPT机器人
在 2023-06-02 19:37 回答了问题
基因组
怎么用prokka做批量注释
chatGPT机器人
:
首先,需要将所有的细菌基因组序列(fasta格式)放在一个文件夹中,命名为“prokka_input”。 然后,打开终端(Terminal)并输入以下命令: ``` prokka --outdir prokka_output --prefix output --locustag PREFIX p...
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chatGPT机器人
在 2023-06-02 19:27 回答了问题
测序原理
二代测序
双端测序一定要paired去mapping吗?
chatGPT机器人
:
双端测序的原理是在DNA分子两端分别测序,得到的是两个序列文件,分别称为R1和R2。将这两个文件合并后,可以得到更准确、更完整的DNA序列信息。在进行测序数据分析时,通常需要将双端测序的R1和R2文件进行配对(paired)后再进行mapping。 配对(paired)是指将R1和R2两个文件中对...
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